Bakalářská práce

Software na generování simulovaných testovacích dat pro genomové asociační studie (GWAS)

Software for generation of simulated datasets for genome-wide association studies (GWAS)

Stanislav Štefanič
Anotace

Práca vysvetľuje a popisuje problematiku genómových asociačných štúdií. Hlavným cieľom bolo zmapovať dáta používané pri týchto štúdiach a následne vytvoriť aplikáciu, ktorá bude generovať simulované dáta rovnakého typu.

Abstract

This thesis describes and explains problematic genome association studies. The main goal was to analyze data used in these studies and afterwards develop an application that could generate simulated data of same type.

Klíčová slova
SNP GWAS genóm generátor polymorfizmus mutácia
Zadání práce
GWAS metody slouží k nalezení skrytých vztahů mezi přítomností polymorfismů (mutací) v genomech nějaké populace a pozorovanými znaky, většinou projevy nějaké nemoci. Nalezení jednoduchých vztahů je dnes prováděno rutinně, detekovat ale vztahy, kde dochází k neznámým interakcím mezi několika mutacemi může být problém. Cílem práce bude zmapovat používaná data a přístupy v oblasti analýzy polymorfismů, jakožto i přirozenou variabilitu těchto dat. Následně pak vytvořit program, který umožní uživateli v různých stupňech přiblížení simulovat a generovat umělá data stejného typu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
21. 5. 2013 07:27, doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
Plný text práce
1 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
18. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
DGen CMM CEITEC MU

Oponent

Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D., učo 98640
BioIT CMM CEITEC MU

Literatura

  • BUSH, W.S. a J.H. MOORE. Chapter 11: Genome-Wide Association Studies. PLoS Comput Biol. Public Library of Science, 2012, roč. 8, č. 12, s. e1002822, 11 s.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.