Bachelor's thesis

Structure and function of flavinreductases

Struktura a funkce flavinreduktas

Dominik Banáš
Abstract

Flavínreduktázy, či už samy alebo v kooperácii s monooxygenázami, tvoria veľmi dôležitú súčasť enzymatickej mašinérie redoxného metabolizmu ktorejkoľvek bunky. Porozumenie štruktúrnych a funkčných aspektov týchto enzýmov prehlbuje biochemické znalosti o bunečnom metabolizme a nachádza svoje praktické uplatnenie v biotechnológiach. V tejto bakalárskej práci sme sa zamerali na produkt génu Pden_5119 …more

Abstract

Flavinreductases, either alone or in co-operation with monooxygenases, create a very important part of the enzymatic machinery of redox metabolism in any cell. Understanding structures and functions of these enzymes deepens biochemical knowledge of cellular metabolism and finds practical application in biotechnology. In this bachelor thesis, we have focused on the protein product of the gene Pden_5119 …more

Keywords
flavínreduktázy monooxygenázy proteín-proteínové interakcie flavoenzymológia Pden_5119 Pden_5013 Pden_5007 flavinreductases monooxygenases protein-protein interactions flavoenzymology
Thesis description
Redukované volné formy flavinů (FMNH2 a FADH2) vznikají v buňkách činností enzymů flavinreduktas. Protože snadno podléhají oxidaci kyslíkem, předpokládá se, že mohou být předávány z místa vzniku do místa spotřeby během přímého kontaktu zúčastněných proteinů. V teoretickém úvodu bakalářské práce budou shrnuty současné poznatky o funkci redukovaných flavinů v buňce, o struktuře a mechanismu působení flavinreduktas a o metodách studia protein-proteinových interakcí. Praktická část se bude týkat NAD(P)H-dependentní flavinreduktasy, kódované genem 5119 bakterie Paracoccus denitrificans. Izolovaný rekombinantní enzym s C-terminální hexahistidinovou bude navázán na vhodný nosič ve formě Co- nebo Ni-komplexu a následně bude inkubován s cytosolem připraveným z buněk bakterie P. denitrificans, kultivovaných standardním způsobem nebo s methylviologenem jako redoxním stresorem. Bude též testováno možné ovlivnění interakce přídavkem flavinu. Zachycené proteiny (potenciální interakční partneři studované flavinreduktasy) budou eluovány a identifikovány pomocí hmotnostní spektrometrie.
Administrative information
The thesis has been checked:
15/5/2017 06:59, prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., UČO 911
Full text of thesis
3 MB / file PDF
Language used
Slovak Slovak
Defence date
13/6/2017
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., UČO 911
ÚBioch Chem PřF MU

Reader

The author of the thesis report has not been identified yet.

Consultant

Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D., UČO 21931
ÚBioch Chem PřF MU

Literature

  • PERNIKÁŘOVÁ, Vendula; Vojtěch SEDLÁČEK; David POTĚŠIL; Iva PROCHÁZKOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Pavel BOUCHAL and Igor KUČERA. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2015, vol. 125, July, p. 68-75. ISSN 1874-3919. Available from: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2015.05.002.
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Biochemistry
Field of Study

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.